Systematische Stellung
Muscheln (Bivalvia) sind eine Klasse der Weichtiere (Mollusca) und umfassen nach heutigem Kenntnisstand etwa 8.000 rezente Arten. Im Süßwasser sind rund 1.200 Arten beheimatet.
Die Flussperlmuschel gehört zu sehr diversen Überfamilie der Unionoidea (Flussmuschelähnliche). Diese umfassen die Familien Margaritiferidae (Flussperlmuscheln) und Unionidae (Flussmuscheln), die mit 700 Arten die artenreichste Familie der Muscheln darstellen. In Österreich bildet die Flussperlmuschel Margaritifera margaritifera die einzige Vertreterin der Gattung Margaritifera.
Stamm: Mollusca (Weichtiere)
Klasse: Bivalvia (Muscheln)
Unterklasse: Metabranchiata
Überordnung: Eulamellibranchiata
Ordnung: Heterodonta
Überfamilie: Unionoidea (Flussmuschelähnliche)
Familie: Margaritiferidae (Flussperlmuscheln)
Gattung: Margaritifera (SCHUMACHER, 1816)
Art: Margaritifera margaritifera (LINNAEUS, 1758)
Systematik nach BIELER & MIKKELSEN (2006) & ZOOLOGICAL RECORD